Patologická anatomie je lékařský vědní obor, který se zabývá etiopatogenezou a morfologickými projevy nemocí zaměřuje se na studium a určování příčin patologických změn a na molekulární a buněčné úrovni. Zkoumá podstatu, příčinu, důvod a vývoj chorobných procesů v organismu.
Tento název je novější označení pro dřívější termín klasická patologie.
Patologická anatomie studuje morfologické změny a studijní materiály získává za pomoci pokusů na zvířatech, pitvou zemřelých lidí a mikroskopickým vyšetřením tkáňových vzorků chirurgicky vyňatých nebo jiným způsobem odebraných ze živých organismů. Tento způsob získávání a zkoumání vzorků se nazývá biopsie.
S anatomickou patologií úzce souvisí také soudní lékařství, které napomáhá řešení důkazních otázek pro potřeby práva.
I když má obor přídech smrti, slouží hlavně životu, protože se zabývá nejen zkoumáním příčin úmrtí a změnami, které ke smrti přispěly, ale z výsledků se odborníci učí, jak těmto příčinám a pochodům zamezit.
Patologické vzorky se také odebírají při určitých onemocněních, kdy je podezření na zhoubné nádorové bujení a kromě běžného postupu, kdy je na prozkoumání vzorku tkáně třeba několik dní se provádějí také orientační testy přímo při operacích, které trvají jen několik minut a určí, zda je stav patologický a je nutno tkáň odebrat.
Zpracování biologických vzorků se zabývají odborníci v bioptických a cytologicko-patologických laboratořích.
