Lékařská mikrobiologie je medicínský obor, který se zabývá studiem morfologických a fyziologických vlastností mikrorganismů a zaměřuje se na ekologické a epidemiologické souvislosti jednotlivých mikrobiálních skupin. Do tohoto oboru patří bakteriologie, virologie nebo parazitologie, sérologie nebo mykologie.
V rámci svého zaměření se obor zabývá mikrobiologickou diagnostikou infekčních nemocí, zajišťuje služby zaměřené na jejich léčbu, profylaxi a prevenci.
Zejména v oblasti prevence minimalizuje komplikace v terénní, ambulantní nebo nemocniční péči.
Odborníci, kteří se zabývají lékařskou mikrobiologií diagnostikují v laboratorních podmínkách infekční nemoci, jejich případné komplikace a zajišťují rychlý diagnostický servis pro praktické lékaře a specialisty. Do tohoto oboru patří také dohled nad racionalizací léčby antibiotiky.
Do oboru patří také vyšetřování dárců krve a krevní plazmy, prevence infekčních komplikací u kriticky nemocných na odděleních intenzivní péče a laboratorní diagnostika mikroorganismů patogenních nebo jinak významných pro zdraví populace.
Odborníci na lékařskou mikrobiologii se, mimo jiné, neustále vzdělávají v metodologii se zaměřením na interpretaci výsledků do klinické praxe.